Projet d’analyse génomique de la bactérie responsable du « cochon graisseux »
Auteurs : Dr Antony Vincent, Dr Steve Charette, Dre Martine Denicourt et Dre Marie-Ève Lambert
CRIPA, Fonds de recherche du Québec, Université de Montréal, Université Laval
Article publié dans La terre de chez nous le 3 juin 2024 : https://www.laterre.ca/chroniques/page-de-conseils/projet-danalyse-genomique-de-la-bacterie-responsable-du-cochon-graisseux/
La bactérie Staphylococcus hyicus peut entraîner des problèmes de santé et de bien-être chez les porcelets, provoquant une affection cutanée connue sous le nom d’épidermite exsudative ou de « cochon graisseux ». Bien que cette bactérie soit couramment retrouvée dans les troupeaux de porcs à travers le monde, peu de données génétiques sont disponibles à son sujet. Dans le but d’améliorer notre compréhension de cette bactérie, des chercheurs du Centre de recherche en infectiologie porcine et avicole (CRIPA) provenant de l’Université Laval et de l’Université de Montréal ont entrepris un projet visant l’étude de souches de cette bactérie isolées de porcs de l’est du Canada, dont quatre pour lesquelles une analyse de leur bagage génétique a été réalisée.
Ces quatre souches ont été identifiées à partir d’échantillons de porcelets présentant des signes d’ épidermite exsudative et/ou de boiterie. Après leur isolation et identification, le génome de chaque souche a été séquencé. Les données obtenues ont révélé des informations précieuses sur leur génétique.
L’étude révèle une diversité génétique des Staphylococcus hyicus même au sein d’une même région. D’autre part, l’analyse des gènes de résistance aux antibiotiques indique que ces quatre souches sont résistantes à la tétracycline, un antibiotique couramment utilisé dans l’industrie porcine.
Deux gènes distincts de résistance à la tétracycline ont été identifiés dans les souches étudiées, ce qui illustre une adaptation de ces bactéries aux traitements antibiotiques et confirme les suspicions des vétérinaires sentinelles du Réseau d’alerte et d’information zoosanitaire (RAIZO) porcin mentionnant les échecs de traitement et les cas récurrents observés en 2022.
Ce projet d’analyse génomique est une première étape dans une initiative de plus grande ampleur cherchant à acquérir une connaissance approfondie de Staphylococcus hyicus au Québec. Ce travail est rendu possible grâce au soutien du ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec (MAPAQ), du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG) et du programme Nouvelle initiative du CRIPA. Nous invitons les éleveurs à participer à cette première initiative s’attaquant à l’épidermite exsudative et à en discuter avec leur vétérinaire traitant. Une compensation financière est prévue pour les participants. Ces avancées dans la compréhension de la génétique de Staphylococcus hyicus ouvriront la voie à de nouvelles stratégies de lutte plus efficaces contre cette bactérie chez les porcs.
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